Стэкинг-агрегация и фотодимеризация тиминовых хромофоров в водных растворах poly-T
Малкин В.М.1, Рапопорт В.Л.1
1Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
Email: vlmalkin@yandex.ru
Поступила в редакцию: 2 февраля 2022 г.
В окончательной редакции: 12 февраля 2022 г.
Принята к печати: 25 февраля 2022 г.
Выставление онлайн: 7 апреля 2022 г.
Методами люминесцентной и абсорбционной спектроскопии установлена гетерогенность водных растворов политимидиловой кислоты (poly-T) при комнатной температуре. Выявлены две фракции тиминовых хромофоров: 1) фотоактивная фракция, состоящая из двух типов стэкинг-агрегатов с оптимальной для фотодимеризации структурой, первому типу соответствуют полосы поглощения - 250 и 280 nm (экситонное расщепление 4300 cm-1), второму - 260 и 290 nm (экситонное расщепление 4000 cm-1); 2) фотохимически интактная с максимумом спектра поглощения у 270 nm и без признаков экситонного расщепления, состоящая, вероятно, из относительно изолированных хромофоров. Ключевые слова: политимидиловая кислота, спектры поглощения, люминесценция, фотодимеризация, фотоаддукт, фототример, фототетрамер.
- К. Смит, Ф. Хэнеуолт. Молекулярная фотобиология (Мир, Москва 1971). [Hendric C. Smith, Philip C. Hanawalt. Molecular photobiology. Academic Press, New York, London, 1969]
- В.Л. Рапопорт. В: Тезисы докладов Всесоюзной школы-семинара по биомолекулярному компьютингу. 27-31 Мая (Москва, 1991), с. 40
- Ei Yano, S. Tatsuura. Thin Solid Films, 196 (1), 147 (1991)
- G.J. Fisher, H.E. Johns. In: Photochemistry and Photobiology of Nucleic Acids. V. I (Academic Press, New York, 1976), p. 225-294
- А.В. Бородавкин, Э.И. Будовский, Ю.В. Морозов, Ф.А. Савин, Н.А. Симукова. Электронная структура, УФ-спектры поглощения и реакционная способность компонентов нуклеиновых кислот. Серия Молекулярная биология: вып. 14 (ВИНИТИ, Москва, 1977), с. 228
- S.Y. Wang. In: Photochemistry and Photobiology of Nucleic Acids. V. I (Academic Press, New York, 1976), p. 296-356
- J. Eisinger, A.A. Lamola. Molecular Photochemistry, 1, 209 (1969)
- M. Kasha, H.R. Rawls, M. Ashraf El-Bayomi. Pure and Applied Chemistry, 1 (3-4), 371 (1965)
- В.Л. Рапопорт, В.М. Малкин, С.В. Зорина, С.М. Комаров, В.В. Горючко. ДАН, 406 (3), 402 (2006). [V.L. Rapoport, V.M. Malkin, S.V. Zorina, S.M. Komarov, V.V. Goryuchko. Doklady biochemistry and biophysics, 406 (1), 23 (2006)]
- В.Л. Рапопорт, В.М. Малкин. Биофизика, 58 (5), 734 (2008). [V.L. Rapoport, V.M. Malkin. Biophysics, 53 (5), 336 (2008)]
- В.М. Малкин, В.Л. Рапопорт. Химическая физика, 22 (4), 3 (2003)
- В.М. Малкин, В.Л. Рапопорт. Вестник СПбУ Сер. 4 (физика, химия), 3 (18), 108 (1999)
- R.A. Deering, R.B. Setlow. Biochimica Biophysica Acta, 68, 526 (1963)
- P. Vigny, J.P. Ballini. In: Excited States in Organic Chemistry and Biochemistry (Dordrecht, 1977), p. 1-13
- В.М. Малкин, В.Л. Рапопорт. Биофизика, 50 (6), 1013 (2005). [V.M. Malkin, V.L. Rapoport. Biophysics, 50, 6 (2005) p. 874-878]
- С. Паркер. Фотолюминесценция растворов (Мир, Москва, 1972) [C.A. Parker. Photoluminescence of Solutions. (Elsevier Publishing Co., Amsterdam-London-New York, 1968)]
- Н.К. Кочетков, Э.И. Будовский, Е.Д.Свердлов, Н.А. Симукова, М.Ф. Турчинский, В.Н. Шибанов. Органическая химия нуклеиновых кислот (Химия, Москва, 1970)
- В.М. Малкин, В.Л. Рапопорт. Биофизика, 44 (6), 1027 (1999). [V.M. Malkin, V.L. Rapoport. Biophysics, 44 (6), 992 (1999)]
- R. Gerdill. Acta Crystallographica, 14 (4), 333 (1961)
- В. Зенгер. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот (Мир, Москва, 1987). [W. Saenger. Principles of Nucleic Acid Structure (Springer, New York, 1984)]
- A. Johnson, O. Wiest. J. Physical Chemistry: B, 111 (51), 14398 (2007)
Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.
Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.