Анализ электростатического взаимодействия димерных комплексов. II. Критерии и условия, предъявляемые к ингибиторам производных белка АРР
Кошлан Т.В.
1, Куликов К.Г.
21Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, Россия
2Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург, Россия
Email: unknown2110@gmail.com, kulikov.kirill.g@gmail.com
Поступила в редакцию: 27 декабря 2019 г.
В окончательной редакции: 27 декабря 2019 г.
Принята к печати: 24 января 2020 г.
Выставление онлайн: 21 апреля 2020 г.
Представлены расчеты, методы подбора и даны характеристики ингибиторов образования высокомолекулярных структур амилоидными пептидами, дано объяснение их блокирующему действию. Подробно рассмотрены биофизические требования к ингибиторам, критерии и условия их отбора, которые будут блокировать образование амилоидами структур высокого порядка. В качестве ингибиторов были изучены модифицированные пептиды, которые будут образовывать с амилоидными пептидами устойчивые димеры, предотвращая тем самым вступление амилоидов во все новые биохимические реакции. Рассмотрено вступление амилоидов в биохимические реакции с себе подобными амилоидными пептидами и не будет рассмотрено их возможное реагирование со стенками сосудов. При этом в качестве критерия оценки стабильности димерного комплекса были использованы: логарифм числа обусловленности матрицы потенциальной энергии попарного электростатического взаимодействия между аминокислотными остатками и дифференциальная энтропия для случая многомерного нормального распределения. Ключевые слова: болезнь Альцгеймера, амилоиды, ключевые аминокислотные остатки, пептиды, число обусловленности, изменение меры дифференциальной энтропии.
- Budd Haeberlein S., O'Gorman J., Chiao P., Bussiere T., von Rosenstiel P., Tian Y., Zhu Y., von Hehn C., Gheuens S., Skordos L., Chen T., Sandrock A. // J. Prev. Alzheimers Dis. 2017. Vol. 4. N 4. P. 255--263
- URL:https://www.alzforum.org/therapeutics/gantenerumab (дата обращения 6.12.2019)
- Koshlan T.V., Kulikov K.G. Mathematical ModelInh of Protein Complexes. SprInher: Nature, 2018. 367 p
- Кошлан Т.В., Куликов К.Г. // ЖТФ. 2018. Т. 88. Вып. 8. С. 1137--1149
- Кошлан Т.В., Куликов К.Г. // ЖТФ. 2018. Т. 88. Вып. 8. С. 1150--1159
- Protein data bank --- URL:https://www.rcsb.org/(дата обращения 6.12.2019)
- Qiu T., Liu Q., Chen Y.X., Zhao Y.F., Li Y.M. Abeta42 and Abeta40: similarities and differences // SpecialIssue: 13th Chinese International Peptide Symposium. 2015. Vol. 21. N 7. P. 522--529
- Glenner G.G., Wong C.W. // Biochem Biophys. Res. Commun. 1984. Vol. 120. N 3. P. 885--890
- Hardy J., Allsop D. // Trends Pharmacol. Sci. 1991. Vol. 12. N 10. P. 383--388
- Selkoe D., Hardy J. // EMBO Mol. Med. 2016. Vol. 8. N 6. P. 595--608
- Cohen S.I., Linse S., Luheshi L.M., Hellstrand E., White D.A., Rajah L., Otzen D.E., Vendruscolo M., Dobson C.M., Knowles T.P. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2013. Vol. 110. N.24. P. 9758--9763
- Sandberg A., Luheshi L.M., Sollvander S., Pereira de Barros T. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2010. Vol. 107. N 35. P. 15595--155600
- Benilova I., Karran E., De Strooper B. // Nature Neurosci. 2012. Vol. 15. N 3. P. 349--357
- Wei H., Schulten K. // J. Am. Chem. Soc. 2014. Vol. 136. N 35. P. 2450--12460
- Yang X., Meisl G., Frohm B., Thulin E., Knowles T.P.J., Linse S. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2018. Vol. 115. N 26. P. E5849--E5858
- Hsu F., Giovanna Park G., Gu Z. // ACS. Omega. 2018. Vol. 3. N 7. P. 84018407
- Phillips J.C. // ACS Chem. Neurosci. 2019. Vol. 10. N 6. P. 2843--2847
Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.
Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.