Оптика и спектроскопия
Авторам
Вышедшие номера
- 2024
- 2023
- 2022
- 2021
- 2020
- 2019
- 2018
Морфологический анализ изолированных астроцитов с использованием фазово-контрастной микроскопии
Российский научный фонд, Президентская программа исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными, 22-72-10128
Широкова А.А.
1, Яковлев Е.В.
1, Симкин И.В.
1, Колотьева Н.А.
1,2, Новикова С.В.
1,2, Насыров А.Д.
1, Денисенко И.Р.1, Гурский К.Д.1, Шишков И.Н.1, Нарзаева Д.Е.
1,2, Салмина А.Б.
1,2, Юрченко С.О.
1, Крючков Н.П.
1
1Московский государственный технический университет им. Н.Э. Баумана, Москва, Россия 
2Научно-исследовательский центр неврологии, Москва, Россия
2Научно-исследовательский центр неврологии, Москва, Россия
Email: shirokova2001@yandex.ru, yakov.egor@gmail.com, simkiniv@gmail.com, st.yurchenko@mail.ru, kruchkov_nkt@mail.ru
Поступила в редакцию: 3 мая 2024 г.
В окончательной редакции: 19 июня 2024 г.
Принята к печати: 30 октября 2024 г.
Выставление онлайн: 12 февраля 2025 г.
Представлен новый метод сбора и анализа данных для создания цифровых двойников клеточных систем. Для сбора данных были проведены эксперименты по ежедневной визуализации роста астроцитов в течение 18 дней со второго дня культивации. Полученные изображения были размечены и на их основе обучена нейронная сеть Mask R-CNN. Из детектированных астроцитов были выделены такие признаки, как длины всех отростков астроцитов Lt, количество узлов Nbt и общая площадь астроцитов Vt. Полученные параметры были определены как функции времени культивации. Полученные временные зависимости будут использованы для создания цифрового двойника изолированных клеток астроцитов. Ключевые слова: цифровой двойник, астроциты, фазово-контрастная микроскопия, машинное обучение.
- J.A. Bull, F. Mech, T. Quaiser, S.L. Waters, H.M. Byrne. PLoS Comput. Biol., 16 (8), e1007961 (2020). DOI: 10.1371/journal.pcbi.1007961
- J. Metzcar, Y. Wang, R. Heiland, P. Macklin. JCO Clin. Cancer Inform., 3, 1-13 (2019). DOI: 10.1200/CCI.18.00069
- G. Xu, H. Fang, Y. Song, W. Du. Agriculture, 13 (1), 142 (2023). DOI: 10.3390/agriculture13010142
- M. Al Bakir, A. Huebner, C. Martinez-Ruiz, K. Grigoriadis, T.B.K. Watkins, O. Pich, D.A. Moore, S. Veeriah, S. Ward, J. Laycock, D. Johnson, A. Rowan, M. Razaq, M. Akther, C. Naceur-Lombardelli, P. Prymas, A. Toncheva, S. Hessey, M. Dietzen, E. Colliver, A.M. Frankell, A. Bunkum, E.L. Lim, T. Karasaki, C. Abbosh, C.T. Hiley, M.S. Hill, D.E. Cook, G.A. Wilson, R. Salgado, E. Nye, R.K. Stone, D.A. Fennell, G. Price, K.M. Kerr, B. Naidu, G. Middleton, Y. Summers, C.R. Lindsay, F.H. Blackhall, J. Cave, K.G. Blyth, A. Nair, A. Ahmed, M.N. Taylor, A.J. Procter, M. Falzon, D. Lawrence, N. Navani, R.M. Thakrar, S.M. Janes, D. Papadatos-Pastos, M.D. Forster, S.M. Lee, T. Ahmad, S.A. Quezada, K.S. Peggs, P. Van Loo, C. Dive, A. Hackshaw, N.J. Birkbak, S. Zaccaria, TRACERx Consortium, M. Jamal-Hanjani, N. McGranahan, C. Swanton. Nature, 616 (7957), 534-542 (2023). DOI: 10.1038/s41586-023-05729-x
- M. Fujiwara, M. Imamura, K. Matsushita, P. Roszak, T. Yamashino, Y. Hosokawa, K. Nakajima, K. Fujimoto, S. Miyashima. Curr. Biol., 33 (5), 886-898.e8 (2023). DOI: 10.1016/j.cub.2023.01.036
- S. Loerakker, T. Ristori, Curr. Opin. Biomed. Eng., 15, 1-9 (2020). DOI: 10.1016/j.cobme.2019.12.007
- E. Vezzoli, C. Cal\`i, M. De Roo, L. Ponzoni, E. Sogne, N. Gagnon, M. Francolini, D. Braida, M. Sala, D. Muller, A. Falqui, P.J. Magistretti. Cereb. Cortex, 30 (4), 2114-2127 (2020). DOI: 10.1093/cercor/bhz226
- Y. Zhou, A. Shao, Y. Yao, S. Tu, Y. Deng, J. Zhang. Cell Commun. Signal., 18, 1-16 (2020). DOI: 10.1186/s12964-020-00549-2
- R. Siracusa, R. Fusco, S. Cuzzocrea. Front. Pharmacol., 10, 479091 (2019). DOI: 10.3389/fphar.2019.01114
- S. Loerakker, T. Ristori. Curr. Opin. Biomed. Eng., 15, 1-9 (2020). DOI: 10.1016/j.cobme.2019.12.007
- A. Horvat, M. Muhiv c, T. Smoliv c, E. Begic, R. Zorec, M. Kreft, N. Vardjan. Cell Calcium, 95, 102368 (2021). DOI: 10.1016/j.ceca.2021.102368
- R.V. Allahyari, K.L. Clark, K.A. Shepard, A.D.R. Garcia. Sci. Rep., 9 (1), 565 (2019). DOI: 10.1038/s41598-018-37555
- Y.C. Cheng, C.J. Huang, W.C. Ku, S.L. Guo, L.T. Tien, Y.J. Lee, C.C. Chien. Stem Cell Rev. Rep., 18 (2), 839-852 (2022). DOI: 10.1007/s12015-021-10319-3
- T. Lu, B. Han, F. Yu. Ecol. Inform., 62, 101277 (2021). DOI: 10.1016/j.ecoinf.2021.101277
- F.R. Mashrur, A.D. Roy, D.K. Saha, in 2019 4th Int. Conf. Electr. Inf. Commun. Technol. (EICT), IEEE (2019), pp. 1-5. DOI: 10.1109/EICT48899.2019.9068806
- H.F. Tsai, J. Gajda, T.F. Sloan, A. Rares, A.Q. Shen. SoftwareX, 9, 230-237 (2019). DOI: 10.1016/j.softx.2019.02.007
- I. Suleymanova, T. Balassa, S. Tripathi, C. Molnar, M. Saarma, Y. Sidorova, P. Horvath. Sci. Rep., 8 (1), 12878 (2018). DOI: 10.1038/s41598-018-31284-x
- A. Mencattini, A. Spalloni, P. Casti, M.C. Comes, D. Di Giuseppe, G. Antonelli, M. D'Orazio, J. Filippi, F. Corsi, H. Isambert, C. Di Natale, P. Longone, E. Martinelli. Patterns, 2 (6), 100261 (2021). DOI: 10.1016/j.patter.2021.100261
Подсчитывается количество просмотров абстрактов ("html" на диаграммах) и полных версий статей ("pdf"). Просмотры с одинаковых IP-адресов засчитываются, если происходят с интервалом не менее 2-х часов.
Дата начала обработки статистических данных - 27 января 2016 г.
